LED农业照明研究投入不足。日本、韩国政府对于LED在生物领域的应用高度重视，政府和大企业、大集团巨资投入该领域的研发与示范应用。尽管国家发展改革委、财政部、科技部、工业和信息化部、住房城乡建设部等国家六部委出台半导体照明节能产业发展意见，意见中明确提出：发展医疗、农业等特殊用途的半导体照明产品。但是并没有专项支持，我国政府LED农业应用的项目支持只是在863半导体照明专项中有零星的项目支持，在农业科技项目中还没有任何专项给予支持，这与LED农业领域存在的巨大应用潜力极不相称。
   LED光源技术成熟度还有待提高。虽然LED技术已经广泛应用于显示屏、背景光、交通讯号显示光源、汽车用灯等多个领域，并取得成功，但LED在我国农业领域的应用才刚刚起步。目前，研究已经证明LED在农业领域应用的可行性，但是在农业LED光源开发方面仍缺乏适用于农业生产的精确可靠的光源技术指标体系，这主要是国家在LED农业应用研究方面的投入不够，应用基础研究力度不足所致，需要国家加大支持力度，对其作进一步深入的研究，形成一套成熟完善的农业LED光源技术，为农业LED光源的进一步开发利用提供理论依据于技术支持。
   LED农业照明企业竞争力不强目前国内生产LED农业照明灯具的企业中，生产中低端产品的中小企业占据了大多数，缺乏核心自主知识权和系统性研究，能够参与国际竞争的龙头企业集团寥寥无几。此外，LED农业照明产品良莠不齐，产业化与标准化程度较低，成本较高，缺乏市场竞争力。而在国外，包括飞利浦、欧司朗等国际著名照明公司已经开始涉足LED农业照明应用市场，他们以雄厚的资本布局这一领域的研发、制造和推广应用，如果我们应对不及时或者力度不够，很可能会在不久的将来，我们将遭遇到我国种业目前所面临的痛失话语权的尴尬境地。
   LED成本仍然偏高。成本是一个产品能否具有市场竞争力的关键因素，也决定了这种产品能否得到用户的认可，能否占据一定的市场份额。对于LED农业照明光源来说，价格高是限制其发展的主要因素之一。一个功率28W的普通荧光灯管价格为20元左右，而一个功率15W的T8农业LED植物生长灯价格为200元左右。虽然LED光源的价格在以每年20-30%的速度在快速下降，但是与传统光源相比仍然存在较大的价格差额，这在很大程度上限制了LED农业照明光源的应用与推广，今年来，国内新上了300台左右的MOCVD设备，宝石衬底的蓝光芯片产能正处于建设期内，预计几年后，这些产能释放，将大大降低蓝光芯片价格。
   缺乏有效的政策扶持。作为一种新型节能光源，LED照明应用在初期的发展很大程度上是依靠政府政策扶持，为此，国家亦制定颁发了一系列促进LED照明产业发展的政策措施，也的确极大地推动了该产业的发展。相对而言，LED农业照明领域还未得到国家的重视，缺乏有效的政策支持，这也是LED农业照明未得到广泛应用的重要因素。